Patriot Season 2 เรื่องราวเริ่มต้นหลังจากปฏิบัติการในอิหร่านที่เกิดปัญหาหนักหน่วง โดยที่สถานการณ์เลวร้ายลงอย่างรวดเร็ว ทำให้ John Tavner (รับบทโดย Michael Dorman) ต้องรับมือกับผลกระทบจากการปฏิบัติการที่ผ่านมา ในขณะเดียวกัน เขาต้องทำหน้าที่ช่วยชีวิต Edward (รับบทโดย Michael Chernus) น้องชายของเขา ซึ่งติดอยู่ในสถานการณ์ที่ยุ่งเหยิง และยังต้องรับมือกับการตัดสินใจที่ยากลำบากจากพ่อของเขา Tom (รับบทโดย Terry O’Quinn) ที่มีส่วนในการออกคำสั่งปฏิบัติการที่ผิดพลาดในการลอบสังหารผู้สมัครชิงตำแหน่งประธานาธิบดีอิหร่าน ซึ่งตัวเขาเองได้ประกาศสนับสนุนโครงการอาวุธนิวเคลียร์ของประเทศ ในซีซั่นนี้ John ต้องเผชิญกับความท้าทายที่หนักหน่วงขึ้นทั้งในด้านการทำงานและความสัมพันธ์ในครอบครัวที่เริ่มแย่ลง การรักษาความลับ และการจัดการความขัดแย้งที่มาจากทั้งด้านอาชีพและครอบครัวสร้างความตึงเครียดที่ต้องการการตัดสินใจที่เด็ดขาด การต่อสู้เพื่อปกป้องสิ่งที่สำคัญที่สุดของเขาในช่วงเวลาที่อันตรายที่สุด
